В университете установлены 2 вида стипендий: академическая и социальная.
Правила их назначения следующие:

Академическая стипендия назначается:

• студентам первого курса в I семестре на основании приказа о зачислении;
• студентам очной формы обучения, обучающимся за счёт средств федерального бюджета, два раза в год по итогам экзаменационных сессий — сдавшим сессию в установленные сроки на «отлично», или на «хорошо» и «отлично», или на «хорошо»;
• приказом ректора университета по представлению деканов факультетов на основании решения стипендиальной комиссии факультетов;
• максимальный размер академической стипендии составляет два размера стипендии, установленной законодательством РФ.

Социальная стипендия назначается:

• студентам очной формы обучения, обучающимся за счет средств федерального бюджета, нуждающимся в социальной помощи;
• в обязательном порядке студентам из числа детей-сирот; детей, оставшихся без попечения родителей; признанным в установленном порядке инвалидами I, II групп; пострадавшим в результате аварии на Чернобыльской АЭС и других радиационных катастроф; являющимся инвалидами и ветеранами боевых действий;
• успешно сдавшим сессию в установленные сроки и представившим в университет выдаваемую органом социальной защиты населения (по месту жительства) справку для получения государственной социальной помощи (справка представляется ежегодно в стипендиальную комиссию института (администрацию института) не позднее чем за две недели до начала работы стипендиальной комиссии); выплата стипендии приостанавливается при наличии задолженности по результатам экзаменационной сессии;
• студенты, получающие государственную социальную стипендию, имеют право претендовать на получение государственной академической стипендии на общих основаниях;
• размер социальной стипендии равен полуторократному размеру стипендии, установленной законодательством Российской Федерации.

Кроме того, при отличной учебе, достижениях в науке, спорте и художественном творчестве дополнительно к основной федеральной стипендии назначаются именные стипендии – это поддержка талантливой студенческой молодежи, организованная различными фондами и организациями.